基因測序及基因組學平臺,是2012年依托中國農業科技華南創新中心搭建的Illumina公司MiSeq測序儀和NextSeq500測序儀的測序平臺??梢葬槍Σ煌男枨髮崿F更專門的應用,提供多種測序讀長、通量和時間周期選擇,滿足各類科研及應用需求對成本和速度的差異化需求。應用于復雜疾病、農業基因組學、微生物學和宏基因組學等研究領域; 可與傳統臨床醫學、動物醫學的最新科研結果結合,形成精準醫療,為疾(疫)病診斷、治療、臨床決策、毒株變異監測等帶來革命性、顛覆性、去“卡脖子”性的改變及發展。
一、服務內容:
主要為科研、高校、企業研發機構等提供完整的基因檢測研究方案,集咨詢、樣品制備、建庫、測序、數據質量檢測、深度的生物信息分析為一體。根據用戶要求進行個性化實驗設計及數據分析,解決數據分析難題和提供論文撰寫咨詢。
主要服務內容:新基因組測序-組裝, 基因組重測序-SNP分析,簡化基因組測序-QTL定位,轉錄組測序-組裝-差異表達基因分析等。
精準服務項目包括:
l 動植物基因組測序
全基因組de novo測序
l 外顯子組測序
SNP遺傳圖譜構建
全基因組關聯分析
BSA性狀定位分析
群體進化分析
l 動植物轉錄組測序
全長轉錄組
宏轉錄組測序
比較轉錄組測序
lncRNA測序
circRNA測序
small RNA測序
l 動植物表觀組測序
全基因組甲基化測序
ChIP-seq
RIP-seq
l 微生物基因組測序
細菌基因組de novo測序
真菌基因組de novo測序
16S/18S/ITS等擴增子測序
宏基因組測序
二、服務流程
從材料選取,建庫測序,到數據分析,確??茖W和縝密,以保障高質量研究成果。
三、應用案例
(一)科研服務:被廣泛應用于復雜疾病、農業基因組學、微生物學和宏基因組學等研究領域。
(Genes, 2020, 11:161-179) (Microbiology resource announcement, 2019,3: e01552-18)
儀器設備 應用領域
代表成果(論文)
MiSeq
轉錄組測序
MiSeq
微生物基因組測序
(二)產業服務:
1.養殖:易感基因篩查、早期診斷、精準監測、精準免疫;
2.疫苗: 疫苗毒株篩選分析;臨床變異監測;靶標挖掘;數據庫建設;
3.微生物:優勢菌篩選,精準調控;保種,靶標挖掘;
4.其他:基因數據分析及基因數據庫定制。
聯系方式
聯系人:朱老師
聯系電話: 020-85161412,13826466467
電子郵箱:zhuqingfeng @agrogene.ac.cn
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